La historia del CUC se puede dividir en cuatro etapas:
Primera Etapa:
La primera etapa parte de los esfuerzos de los compañeros y compañeras desde el 1972 para formar una organización que diera respuesta a la represión militar y la opresión económica que se vivía en este momento.
Segunda Etapa:
La segunda etapa empieza con el nacimiento del CUC en el 1978 y dura hasta el 1982, cuando la represión obligó a la organización a desarticular sus estructuras oficiales para trabajar en la clandestinidad.
Tercera Etapa:
La tercera etapa abarca el período del año 1982, con la reestructuración de la organización en el 1985, y hasta la firma de la paz en diciembre 1996.
Cuarta Etapa:
La cuarta etapa comprende el período desde la firma de la paz hasta la actualidad.